System równoważny można łączyć z pracą zmianową albo z tzw. ruchomym czasem pracy. Można też zgodzić się na indywidualny rozkład czasu pracy w systemie równoważnym. Nie wolno natomiast łączyć go np. z zadaniowym systemem czasu pracy.

Trzeba też pamiętać o obowiązku tworzenia rozkładów i ogłaszania ich z tygodniowym wyprzedzeniem.